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51NOD 1116 K进制下的大数(字符串取模 + 枚举)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:53
传送门 1116 K进制下的大数 基准时间限制:1 秒 空间限制:131072 KB 分值: 20 难度:3级算法题 收藏 关注 有一个字符串S,记录了一个大数,但不知这个大数是多少进制的,只知道这个数在K进制下是K - 1的倍数。现在由你来求出这个最小的进制K。 例如:给出的[详细]
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poj3181 Dollar Dayz (DP+大数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:107
Dollar Dayz Crawling in process... Crawling failed Time Limit: 1000 MS???? Memory Limit: 65536 KB???? 64bit IO Format: %I64d %I64u Submit Status Practice POJ 3181 Appoint description: System Crawler (2016-05-27) Description Farmer John goe[详细]
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基因数据处理40之bedtools的安装和使用
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:132
1.下载: git clone https: //github.com/arq5x/bedtools.git 2.编译: make 3.配置: cp * /usr/local /bin/ 4.运行: bam变成bed hadoop @Master :~/xubo/data/snap $ bamToBed -i datatest.sorted.bam datatest.sorted.bed 查看: hadoop @Master :~/xubo[详细]
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基因数据处理42之mango问题_seqdict.avro不存在解决
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:145
参考【1】中问题解决 问题分析:这是新版本的问题:adam0.19.1目前在maven中心仓库没有 解决办法: package org.gcdss.test import java.io.File import java.nio.file.Files import org.apache.parquet.hadoop.metadata.CompressionCodecName import org.ap[详细]
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基因数据处理43之mango之503错误
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:133
HTTP ERROR : 503 Problem accessing /. Reason : Service Unavailable Powered by Jetty :// 更详细请见: https://github.com/bigdatagenomics/mango/issues/181[详细]
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推荐系统技术之文本相似性计算(三)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:115
今天这篇也比较长,但中间有部分是代码,7,8,9最后三节的信息我认为较为有用。 前面说了两篇了,推荐系统技术之文本相似性计算(一)和推荐系统技术 --- 文本相似性计算(二)分别介绍了 TFIDF 和向量空间的相关东西,然后介绍了 主题模型 ,这一篇我们就[详细]
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趣图:论修电脑和当医生的相似性
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:155
(点击 上方公众号 ,可快速关注) 既然喝水这么重要,今天来送个福利 ↓↓↓ 据路边社报道,水杯离你越近,喝水的频率将会越高。 借今天的趣图,来团一款方便携带的随手水杯。emoi 品牌,环保,外观设计简洁大方,手感也很不错。密封防漏做的好,可随身携带[详细]
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[生产库实战] 如何合理的使用logmnr进行日志挖掘,并对生产库影
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:135
Oracle Logmnr这个工具怎么用这里就不详细说,可以查看官方文档,网上的文档也一大堆,自己找吧。我这里就直接上干货了。 --创建Oracle目录 select * from dba_directories; create directory archivelog_dir as '/archivelog1/temp_archivelog/'; --grant r[详细]
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基因数据处理44之cloud-scale-bwamem安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:95
cloud-scale-bwamem是在spark等云环境上实现bwa-mem算法,加速对全基因组匹配的处理 1.下载: git clone https: //github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem.git 2.编译: mvn clean package 3.编译成功: [INFO] ----------------------------------------[详细]
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基因数据处理50之cs-bwamem、bwa、snap、bwa-mem与art比较
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:149
直接看结果: (1)art仿真数据: hadoop @Master :~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem $ cat G38L100c50Nhs20 .aln ##ART_Illumina read_length 100 @CM art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522 .fna -l 100 -c 50 -o G38L100c50Nhs20 -rs 1[详细]
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基因数据处理45之cloud-scale-bwamem安装(compile.pl安装有问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:189
脚本: hadoop @Master :~/xubo/tools/cloud-scale-bwamem $ cat compile.pl #! /usr/bin/perl system "mvn clean package" ;chdir "./src" ;system "mvn package -PotherOutputDir" ;chdir "./main/jni_fpga" ;system "mvn package -PotherOutputDir" ;chdi[详细]
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基因数据处理47之ART基因序列数据生成器(仿真)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:58
1.概念: ART基因序列数据生成器 详细请见论文:【1】 和官网【2】 2.下载: ART-bin-GreatSmokyMountains-04.17.16-Linux64.tgz http://www.niehs.nih.gov/research/resources/assets/docs/artbingreatsmokymountains041716linux64tgz.tgz 3.配置 sudo cp到[详细]
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基因数据处理49之cloud-scale-bwamem运行成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:64
1.先使用art生成数据: 请看前一篇 2.上传fastq到hdfs: hadoop @Master :~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem $ spark-submit -- class cs . ucla . edu . bwaspark . BWAMEMSpark -- master local [2] / home / hadoop / xubo / tools / cloud - s[详细]
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基因数据处理48之ART使用实例
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:78
相关参数请见上一篇 1.使用实例1: hadoop @Master :~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem $ art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522 .fna -l 100 -f 20 -o G38L100F20Nhs20 ==================== ART ==================== ART_Illumina ( 200[详细]
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求0至大数之间的随机数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:199
题目:给定一个String类型的大数(非负整数),不能直接转化为Integer,类似如下要求 The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is? NOT ?allowed. You should? NOT ?use internal library such as[详细]
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Twitter开源大数据实时分析系统Heron:Heron架构
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:72
Heron架构 Heron是Apache Storm的一个直接继承者。从架构角度来看,它与Storm截然不同,但是从API的角度看它是完全向后兼容的。 下面的章节指明了Heron和Storm的区别,描述了Heron背后的设计目标,并解释了其架构的主要组件。 代码库 Heron代码库的详细指南[详细]
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大数据分析界的“神兽”Apache Kylin初解
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:114
转自李栋,来自Kyligence公司,也是Apache Kylin Committer PMC member,在加入Kyligence之前曾就职于eBay、微软。 今天分享的主题是:聊聊“神兽”Apache Kylin的最新特性。本次分享将首先对Apache Kylin进行基本介绍;接下来介绍1.5.x最新版本在架构上的重[详细]
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kylin-BI工具-tableau9
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:158
Tableau 9 Tableau 9.x has been released a while,there are many users are asking about support this version with Apache Kylin. With updated Kylin ODBC Driver,now user could interactive with Kylin service through Tableau 9.x. Apache Kylin cu[详细]
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Presto随笔
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:119
解决了什么问题 快读的交互式查询 presto 和hive到底什么关系 http://www.mutouxiaogui.cn/blog/?p=395 和hive在一个层级,都是基于hdfs的。但是presto可以借助hive的元信息找到hdfs上的节点。 presto现在已经可以连接 MySQL postgre hive等了 presto为什么[详细]
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HDOJ/HDU 5686 Problem B(斐波拉契+大数~)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:187
Problem Description 度熊面前有一个全是由1构成的字符串,被称为全1序列。你可以合并任意相邻的两个1,从而形成一个新的序列。对于给定的一个全1序列,请计算根据以上方法,可以构成多少种不同的序列。 Input 这里包括多组测试数据,每组测试数据包含一个正[详细]
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如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:162
中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机,掘得富矿?中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称:数博会)上发表致辞时,为此描绘出四大清晰路径。 路径一:大数据[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:176
(点击 上方公众号 ,可快速关注) 英文:Anna Nicolauo 译者:伯乐在线 - 胡波 链接:http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长,大数据渗透到了各行各业,广泛应用于公司中,同时也使得传统的软件比如 Excel[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:141
需要注意的是如果使用avocado的命令行,fs和fq为hdfs路径,properties为本地路径: hadoop @Master :~/xubo/data/testTools/se $ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basi[详细]
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LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe(欧拉函数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:132
题目链接: LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe 题意: 给出n个数,要求对每个数a[i]找一个数x[i]使得小于x[i]且与x[i]互素的数的个数不小于a[i],求出所有x[i]的最小和。 分析: 和最小则每个数对应的x[i]应最[详细]
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基因数据处理26之bcftools安装和使用
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:89
1.下载: https://github.com/samtools/bcftools 2.安装 make make install 3.结合samtools使用 对排序好的bam数据用samtools生成bcf文件: xubo @xubo :~/xubo/data/testTools/se $ samtools mpileup -ugf ../hs38DH.fa hs2.sort.bam hs2.bcf 由于生成的是[详细]
